R语言使用逻辑回归和引导LOOCV创建箱形图以评估签名。plotQuantitative()函数-中英文对照帮助文档
By MicroRbt Martinez PhD
R语言函数名:plotQuantitative()
R语言函数功能:使用逻辑回归和引导LOOCV创建箱形图以评估签名。
来自资源库:Bionconductor-software
plotQuantitative()函数所属R语言包:所在R包具体名称、包功能的中英文双语描述见正文后面'--所在R语言包信息--'部分。
描述-----Description-----
This function takes as input a data.frame with genetic expression count data, and uses a bootstrapped leave-one-out cross validation procedure with logistic regression to allow for numeric and graphical comparison across any number of genetic signatures. It creates a boxplot of bootstrapped AUC values.
该函数将带有基因表达计数数据的data.frame作为输入,并使用具有逻辑回归的自举式留一法交叉验证程序,以允许对任意数量的遗传特征进行数字和图形比较。它创建了自举AUC值的箱线图。
使用方法-----Usage-----
plotQuantitative(
df.input,
targetVec.num,
signature.list = NULL,
signature.name.vec = NULL,
num.boot = 100,
pb.show = TRUE,
name = "Signature Evaluation: Bootstrapped AUCs",
fill.col = "white",
outline.col = "black",
abline.col = "red",
rotateLabels = FALSE
)
参数-----Arguments-----
参数df.input介绍: a data.frame of gene expression count data. Required.
基因表达计数数据的data.frame。需要。
参数targetVec.num介绍: a numeric binary vector of the response variabl
-----未完,待续-----,↓↓↓展开剩余72%↓↓↓
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