R语言细胞分类器cell_classifier()函数-中英文对照帮助文档

MicroRbt

        R语言细胞分类器cell_classifier()函数-中英文对照帮助文档

                                         By MicroRbt Martinez PhD

R语言函数名：cell_classifier()
R语言函数功能：细胞分类器
来自资源库：Bionconductor-software
cell_classifier()函数所属R语言包：所在R包具体名称、包功能的中英文双语描述见正文后面'--所在R语言包信息--'部分。

描述-----Description-----

Classifies cells using cell type specific markers.
使用特定于细胞类型的标记对细胞进行分类。


使用方法-----Usage-----

cell_classifier(
data,
genes,
markers = markers_default,
tsne = NULL,
plot.details = FALSE,
write = TRUE,
verbose = TRUE
)

参数-----Arguments-----

参数data介绍: a data frame of n rows (genes) and m columns (cells) of read or UMI counts (note : rownames(data)=genes)
由n行（基因）和m列（单元）的读取或UMI计数组成的数据帧（注意：rownames（data）= genes）

参数genes介绍: a character vector of HUGO official gene symbols of length n
长度为n的HUGO官方基因符号的特征向量

参数markers介绍: a data frame of cell type signature genes
细胞类型特征基因的数据框

参数tsne介绍: (optional) a table of n rows and 2 columns with t-SNE projection coordinates for each cell
（可选）每个单元具有n行2列的表格，其中t-SNE投影坐标

参数plot.details介绍: a logical (if TRUE, then plots the number of cells attributed to one cell type, see below)
逻辑（如果为TRUE，则绘制归因于一种像元类型的像元数，请参见下文）

参数write介绍: a logical
逻辑上

参数verbose介绍: a logical
逻辑上


详情-----Details-----

The ' marker

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